在果蔬冷庫冷卻降溫之前，檢查并調整制冷系統的控制閥，確保待冷卻降溫倉庫的低壓系統管路暢通，儲液罐和高壓調節站也必須暢通。冷卻降溫開始時，向蒸發器適當地供應液。系統中有一定量的氨后，按正常啟動程序啟動氨冷制壓縮機，使機器投入正常生產。調節蒸發器供液量，使氨水在系統中正常循環，儲存溫度逐漸下降。當儲存溫度達到一定水平時，停止供液，關閉制冷壓縮機，暫停冷卻，達到規定時間后繼續冷卻，直至達到設計要求的低溫。
果蔬冷庫冷卻時，應緊閉倉門，每根蒸發排放管均應磨砂良好。應記錄倉庫的冷卻情況。當儲存溫度達到設計要求時，應停止冷卻，并觀察和記錄儲存溫度的恢復情況。果蔬冷庫溫度達不到設計要求時，應分析原因，妥善處理。
溫度不會下降的原因有很多。設計中制冷系統選擇不當，如壓縮機容量太小，節流閥直徑或管徑選擇不合理，倉庫蒸發器蒸發面不夠；也可能是連接管安裝錯誤或安裝位置不當，或管內局部堵塞，蒸發排放管無結霜，或操作系統閥門調節不好，蒸發器供液不足。應根據情況分析處理
冷卻后，如果儲存溫度迅速上升，應檢查保溫層是否不平或潮濕，以及施工質量是否存在問題。
